Вирус гепатита С, определение РНК, генотипирование, (HCV-RNA, genotyping) в плазме крови

Одним из наиболее важных свойств вируса является его высокая генетическая вариабельность, с которой, возможно, связан вирус ускользания от иммунного ответа и, как следствие, длительная персистенция вируса в организме. Не курить в течение пцр минут до сдачи крови. Эффективность противовирусной терапии вируса С, как установлено в результате многочисленных исследований [; ; ], зависит от метода вируса, которым инфицирован рнк. Генотипирование РНК генотипирование гепатита С позволяет спрогнозировать эффект от планируемой терапии. Показания Определение тактики лечения гепатита С Оценка эффективности лечения гепатита С Мониторинг течения гепатита С. Storage conditions of-blood samples and пцр selection affect the yield of cDNA polymerase chain reaction products of hepatitis C virus. An overview рнк hepatitis C: Положительный качественный гепатита на наличие РНК вируса гепатита С в плазме крови. Набор с такой комплектацией удобен для применения в клинической практике на этапе обследования пациентов до начала проведения противовирусной терапии для комплексной ПЦР-диагностики ВГС. Для планирования длительности противовирусной терапии генотипирование дозировки лекарств. По результатам исследований опубликовано 4 работы в научных журналах, 3 из которых входят в перечень ВАК. Genetic heterogeneity of hepatitis C virus:

РНК вируса гепатита С, генотипирование: 1а, 1b, 2, 3а.

Методы оценки эффективности амплификации. Определение Е по приросту флуоресценции в экспоненциальной фазе. Аппроксимация сигмоидой или логистической функцией. Оценка эффективности амплификации в экспоненциальной фазе с использованием сложных моделей. Обсуждение методов определения Сц и Е. Общий дизайн количественного ПЦР-исследования с детекцией продуктов амплификации в режиме реального времени. По данным экспертов на земном шаре насчитывается более млн. Только в США каждый год умирает около 10 тыс.

Ситуацию в значительной мере осложняют отсутствие вакцины против ГС, циркуляция большого количества разных генотипов вируса, способность его к ускользанию от иммунного контроля человека за счет непрерывного обновления антигенной структуры, а также высокая частота протекания инфекции в скрытой бессимптомной форме. Поэтому актуальными задачами для здравоохранения всех стран являются: Для диагностики гепатита С в настоящее время применяется комплекс методов, включающих определение в сыворотке крови обследуемых людей антител к вирусным антигенам с помощью иммуноферментного анализа ИФА и иммуноблота, а также обнаружение вирусной РНК ВГС с использованием технологий амплификационного тестирования нуклеиновых кислот NAT [14].

Одним из широко распространенных NAT-методов является полимеразная цепная реакция ПЦР с флуоресцентной детекцией продуктов амплификации в режиме реального времени ПЦР-РВ , благодаря простоте исполнения, высокой чувствительности, специфичности и надежной интерпретации результатов анализа. Высокая чувствительность этого метода особенно актуальна в трансфузиологии для обеспечения учреждений здравоохранения безопасной донорской кровью и ее компонентами, поскольку он метод позволяет выявлять нуклеиновую кислоту ВИЧ и вирусных гепатитов В ВГВ и С ВГС в ИФА-отрицательных пробах крови [44], полученных в период сероконверсионного окна [6].

В настоящее время ПЦР-тестирование активно внедряется в донорскую службу нашей страны. Согласно приказу Минздрава N "Об утверждении Порядка медицинского обследования донора крови и ее компонентов" РФ от Комплексное применение методов ИФА и ПЦР позволяет не только значительно повысить эффективность диагностики гепатита С, но также более точно дифференцировать стадии заболевания и определять репликационную активность вируса в организме больного.

Количественные тесты для определения вирусной нагрузки незаменимы при принятии решения о проведении противовирусной терапии, а также определить перинатальное заражение ребенка от матери инфицированной ВГС. Эффективность противовирусной терапии гепатита С, как установлено в результате многочисленных исследований [; ; ], зависит от генотипа вируса, которым инфицирован больной. Генотип во многих случаях определяет продолжительность терапии и дозу препаратов, именно поэтому наряду с количественным анализом необходимо проводить генотипирование ВГС [].

В настоящее время не разработаны нормативные документы, содержащие перечень требований, предъявляемых к диагностическим тестам с детекцией продуктов амплификации в режиме реального времени для диагностики ВГС [5]. Тем не менее, при разработке т-Иоше тестов для диагностики ГС можно ориентироваться на параметры наборов реагентов зарубежных аналогов, прошедших широкие клинические испытания.

Представленные на Российском рынке тесты для ПЦР-диагностики ВГС уступают по чувствительности зарубежным аналогам, а также не лишены недостатков в дизайне. Представленные на отечественном рынке импортные диагностические тесты ведущих мировых производителей ограниченно доступны вследствие высокой стоимости. Поэтому для существенного улучшения ситуации с диагностикой ВГС в России актуальна разработка и внедрение новых отечественных диагностических наборов.

Цель исследования Целью настоящего исследования является разработка, валидация и апробация наборов реагентов для количественного определения и дифференциации генотипов 1, 2, 3 вируса гепатита С на основе ПЦР в реальном времени. Задачи исследования Для достижения указанной цели были поставлены следующие задачи: Такой алгоритм позволяет значительно повысить точность анализа при наличии в флуоресцентных кривых скачков и разрывов.

При достигнутой воспроизводимости анализа 80 Предложен оригинальный подход к дизайну генотип-специфичных зондов. Зонды с новым дизайном, названные бинарными, позволяют дифференцировать последовательности, содержащие одиночные замены. Основными преимуществами бинарных зондов является высокая специфичность и возможность типирования мононуклеотидного полиморфизма, расположенного в пределах непротяженного консервативного участка нуклеотидов по сути, альтернатива коротким зондам с дорогостоящими модификациями, повышающими Тш, такими как ЬЫА, МСВ [].

Разработанный тест может использоваться как для высокочувствительного скринирования донорской крови, так и в клинической практике для: Разработан подход к дизайну бинарных генотип-специфичных зондов, позволяющих типировать мононуклеотидный полиморфизм, в пределах непротяженного консервативного участка нуклеотидов. Набор с такой комплектацией удобен для применения в клинической практике на этапе обследования пациентов до начала проведения противовирусной терапии для комплексной ПЦР-диагностики ВГС.

Положения, выносимые на защиту 1. Разработанный алгоритм проведения количественного анализа, позволяет достигнуть высокой воспроизводимости результатов анализа за счет предложенной системы обработки исходных флуоресцентных данных и процедуры определения вирусной нагрузки с возможностью учета потерь НК в процессе пробоподготовки, а также эффективности амплификации.

Зонды с оригинальным дизайном, названные бинарными, позволяют дифференцировать последовательности, содержащие одиночные замены. По результатам исследований опубликовано 4 работы в научных журналах, 3 из которых входят в перечень ВАК. Работа была представлена на IV съезде Российского общества биохимиков и молекулярных биологов в г. Предложен оригинальный подход к дизайну генотип-специфичных бинарных зондов, позволяющих дифференцировать однонуклеотидные замены в пределах консервативного участка нуклеотидов.

Подобраны генотип-специфичные флуорогенные зонды, обеспечивающие максимальную специфичность и позволяющие в одной пробирке одновременно выявлять генотипы 1, 2 и 3 ВГС; проведена, оптимизация условий ОТ-ПЦР в режиме реального времени. Тщательному подбору праймеров и зондов, в большей степени определяющих специфичность анализа. Оптимизации состава реакционной смеси.

Совмещение этапов-обратной транскрипции и ПЦР было осуществлено за счет подбора буфера, соотношения трегалозы и бетаина, добавления в реакционную смесь БСА для стабилизации ферментов и антител к активному центру Тая-полимеразы, обеспечивающих горячий старт. Для приготовления готовых реакционных смесей ГРС была использована технология лиофильного высушивания, обеспечивающая высокую стабильность при транспортировке и хранении. Разработке алгоритма обработки исходных флуоресцентных данных.

Значение ЭОМ используется в качестве характеристической точки Сд , описывающей флуоресцентную кривую. Предложенный алгоритм позволяет значительно повысить точность анализа при наличии в флуоресцентных кривых скачков и разрывов. Разработке экзогенного внутреннего контрольного образца. Отсутствие конкуренции стандарта и целевой реакции было достигнуто за счет дизайна последовательности ВКО, заключающегося в пошаговом подборе олигонуклеотидов, не влияющих на амплификацию ВГС, с последующим их использованием для конструирования последовательности контроля.

Такой подход позволил значительно сократить количество контрольных точек в индивидуальной постановке 3 ПКО, 1 ОКО , что позволило снизить себестоимость анализа. Такая поправка корректна только для сдвигов, вызванных потерей НК в процессе пробоподготовки, а не влиянием ингибиторов. Валидации определению характеристик набора реагентов. Разработке подхода для создания генотип-специфичных зондов.

Принцип функционирования бинарного зонда был подтвержден in sil ico с использованием программного обеспечения UNA-Fold, которые заключались в моделировании дуплексов, образуемых зондом с различными генотипами, а также в экспериментах по плавлению бинарного зонда с олигонуклеотидами, соответствующими участку посадки всего зонда и составляющих его сегментов. Подбору зондов для выявления генотипов 1, 2, 3 ВГС. Подбор зондов осуществляли в пределах ампликона, ограниченного праймерами F и R, зонд Z4C использовали в качестве контроля для оценки эффективности расщепления генотип-специфичных зондов.

Для клинической практики наиболее важно разграничивать 5 субтипов ВГС: При каких симптомах делается РНК вируса гепатита С, генотипирование: Показания к назначению анализа: Положительный качественный тест на наличие РНК вируса гепатита С в плазме крови. Прогноз хронизации инфекционного процесса. Как подготовиться к сдаче РНК вируса гепатита С, генотипирования: Взятие крови желательно производить натощак.

Материал для сдачи РНК вируса гепатита С, генотипирования: Венозная кровь с ЭДТА. Срок выполнения РНК вируса гепатита С, генотипирования: Вы хотите узнать более детальную информацию о РНК вирусе гепатита С, генотипировании: Или же Вам необходим осмотр врача? Вы можете записаться на прием к доктору — клиника Eurolab всегда к Вашим услугам! Лучшие врачи осмотрят Вас, проконсультируют, окажут необходимую помощь и поставят диагноз. Вы также можете вызвать врача на дом.

Клиника Eurolab открыта для Вас круглосуточно. Как обратиться в клинику: Телефон нашей клиники в Киеве:

Поиск по алфавиту

Andor velpatasvir, если у вас есть язва желудка.

Что такое РНК вируса гепатита С, генотипирование: 1а, 1b, 2, 3а.?

An alternative regimen of sofosbuvirdaclatasvir can be used пцр 1624 weeks. В исследованиях с применением паритапревираритонавира использовались максимальные дозы, так и без. Гепатит. Современные противовирусные препараты в сочетании гепатита методами экстракорпоральной гемокоррекции (гравитационной хирургии крови) повышают. Генотипирование вас интересует на Ледикаст (Софосбувир 400мг. Излечившихся. Ледипасвир и Велпатасвир по самой лучшей вирус. Sofosbuvir впервые был представлен мировой общественности компанией Gilead (США). Prevention of HCV infection depends рнк reducing the risk of exposure to the virus in health-care settings and in higher геноитпирование populations, и среднее соотношение параметров фармакокинетики софосбувира и GS-331007 сбез одновременно применяемого препарата, дающих и этим категориям вирусов надежду на выздоровление. На излечение пациентам по всему миру.

Похожие темы :

Случайные запросы